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Réunion VizieR 13/06/2018

Présents: Gilles L., Emmanuelle P., Tiphaine P., Patricia V., Sylvain Wendel

DOIs VizieR

Pour rappel, des DOIs seront attribués prochainement aux catalogues VizieR. Voir : http://cds.u-strasbg.fr/twiki/bin/view/Ressources/AttributionDOIVizieR
Sylvain W. a travaillé sur la structure du fichier XML qui doit être envoyé à l'organisme Datacite pour créer le DOI.
Il a également travaillé sur la "landing page" : la page sur laquelle un utilisateur sera dirigé lorsqu'il consulte une référence catalogue.

Cette landing page doit remplacer l'actuelle page que l'on obtient en cliquant sur l'onglet "ReadMe+FTP". Notamment, l'onglet Summary a été entièrement revu.

1. Le fichier XML envoyé à datacite

Basé sur la documentation de Datacite http://schema.datacite.org/meta/kernel-3/doc/DataCite-MetadataKernel_v3.1.pdf, les rubriques suivantes ont été définies :

Paramètres Explications
M IDENTIFIER (1) DOI (e: xxxx/CDS/VizieR/catid)
M CREATOR (1-n) auteurs + orcid pour le 1er auteur
M TITLE (1-n)
catalogue title = Short Title du ReadMe
M PUBLISHER (1) Centre de Donnees Strasbourg (CDS)
M PUBLICATIONYEAR (1) année de publication de l'article
R SUBJECT (0-n)
ADC keywords
R CONTRIBUTORS (0-n) "DataCurator" = CDS team
R DATE (0-n)
date "Created" : première mise en ligne
date "Updated" : dernière modification VizieR
O ALTERNATEIDENTIFIER (0-n)
"Internal ID" = Ref. Catalogue (J/... ou I/...)

'ivoid" = Identifiant IVOA pour le catalogue

R RELATEDIDENTIFIER (0-n)
"bibcode" = bibcode de l'article

"DOI" = DOI de l'article

O RIGHTS (0-n) Lien vers la page des utilisations données VizieR
O GEOLOCALISATION (0-1) Strasbourg astrnomical observatory, France

Ce qui donne au final, par exemple : le fichier XML pour J/A+A/620/A20

On a donc, la liste des auteurs - avec l'ORCID du premier auteur s'il existe -- et une fois que le bug chez ADS sera corrigé ; le Short Title ; "CDS" pour le publisher ; "CDS team" pour les "curators"...

=> Pour Sylvain : il n'existe pas de relationType "Title" (c'est seulement en cas de "subtitle" ou "alternate title", etc. cf. doc PDF ci-dessus), c'est pourquoi il y a un message d'erreur avec la comparaison du modèle. Normalement, le relationType n'est pas obligatoire, il suffit donc de le supprimer.

Addendum Sylvain : je confirme qu'il n'y a pas besoin de mettre le title type, le XSD valide.

=> A changer aussi, le relationType pour "bibcode" qui devrait être identique au relationType du "DOI" : ce ne sont que deux manières différentes d'identifier la publication. La relation avec le catalogue est bien "isSupplementTo" (le catalogue est un supplément de la publi) -- "References" est trop vague, la publication est bien plus qu'une simple source d'information...

Modif faite par Sylvain.

L'abstract n'a pas été conservé dans le fichier XML car il pourrait y avoir des problèmes de copyright.

La section description n'a pas été incluse dans le fichier XML car elle n'existe pas toujours pour un catalogue (mais elle se retrouve dans la landing page - voir ci-dessous).

Il y a 2 dates : la première date d'insertion du catalogue (lorsqu'on fait le 2v ) et la date de dernière mise à jour dans VizieR.
La date de dernière mise à jour indique donc qu'il faudra réviser régulièrement la liste des catalogues pour mettre à jour ce fichier XML.

La procédure automatique de création de ce fichier se fera - a priori - à un moment ultérieur au 2v de mise en production locale... A voir. Elle ajoute un tag \DOI et \ArticleDOI au .status/.Summary qui sont respectivement, le DOI du catalogue et le DOI de l'article publié qui est récupéré chez ADS.

On rappelle que le DOI décrit le catalogue VizieR ; il n'y aura donc pas de DOI a priori pour les catalogues uniquement FTP.

2. La landing page correspondante

Actuellement accessible via l'URL : http://cdsarc.u-strasbg.fr/vizier/cat/?J/ApJ/829/L9 ; par exemple (remplacer la ref. cat pour voir celui que vous voulez).

On a en premier le Short Title avec la ref. cat.

Une première section qui permet un accès à VizieR, FTP, ReadMe (à télécharger), TAP, XMatch s'il y a des positions, Saada/FITS s'il y a lieu

=> A priori le bouton "Data" avec l'icône de table en rouge n'est pas assez clair - c'est celui qui est important pour accéder au données VizieR... Gilles va peut-être le modifier pour avoir l'icône VizieR ou "Display catalogue" ou... ? N.B. : C'est le même bouton que celui de la page VizieR home (quand on a une liste de résultats de catalogues) - il faudra donc le modifier ici aussi...

Une deuxième section qui donne :

- à gauche :

  • les auteurs (liste partiellement cachée s'il y en a beaucoup),
  • le bibcode qui renvoie vers ADS et seulement pour nous en interne,
  • le "bibcode (Simbad)" qui renvoie sur SIMBAD (merci :)),
  • il y aura aussi le DOI de l'article qui permettra d'arriver sur la publication directement.
  • les mots-clefs "ADC_Keywords",
  • le type de catalogue ( \cType du .status/.Summary) : observation, models ou compilation,
  • le nombre de records - seulement pour les grands catalogues ( \cRecords du .Summary).
  • la carte du Footprint - en cliquant dessus on obtient un Aladin lite qui affiche le MOC du catalogue et la liste des catalogues donnés en "See also" du ReadMe qui permet d'afficher également les MOCs du catalogue choisi par-dessus.
=> Il faudrait peut-être ajouter une légende à la carte pour indiquer que la map de fond est la couverture VizieR et que la couleur donne la densité d'information dans VizieR ?
  • la date d'insertion
  • la date de dernière modif.
- à droite, différents onglets :
  • Article Origin : reprend le titre, les Keywords et l'abstract de la publication.
=> Ajouter "Abstract:" devant l'abstract - de la même manière que "Keywords".
=> Faire en sorte que les exposants de type ^2^, unités de type M_{sun}_, lettres grecques entre accolades, indices, etc. soient bien interprétés dans l'abstract (comme c'est le cas dans les ReadMe cliquables actuellement).
=> Il faudrait que l'abstract ne soit pas coupé au milieu d'un mot...
  • Description : reprend la section "Description" du ReadMe -- ne s'affiche pas s'il n'y en a pas.
  • See also : reprend la section "See also" du ReadMe -- ne s'affiche pas s'il n'y en a pas.
=> Fait actuellement des liens vers le catalogue VizieR correspondant mais devrait plutôt renvoyer sur la landing page du catalogue.
  • ReadMe : affiche un ReadMe "cliquable" (liens vers les bibcodes et ref catalogues notamment + conversion des indices, exposants, etc.)
  • Browse : affiche l'onglet Browse comme actuellement
=> Gilles va ajouter un onglet "List of tables" qui permet d'accéder au tables VizieR = sorte de résumé des tables disponibles (avec nombre de rows ?) - parfois différentes de celles sur le FTP (également dans Browse).

Et, enfin, une 3è section optionnelle : Une section pour ajouter ce qui nous paraît intéressant à partir du fichier custom.htx qui doit se trouver dans le répertoire correspondant au catalogue (et ne pas être lisible par tous !).
Dans l'exemple ci-dessus, il y a le plot correspondant à l'objet traité dans ce catalogue et une image FITS.
Gilles a créé un tag \vplotImage et \saadaImage pour pouvoir faire les liens.
Lorsqu'on clique sur l'image du plot, le widget s'ouvre.

Quelques autres exemples dans B/cfht : un simple message ou I/345 : Gilles s'est lâché !

Cela peut être pratique pour ajouter les messages que l'on ajoute en commentaire de titre sur les grands catalogues, par exemple.

3. Mise en prod.

Mark doit encore valider le contrat avec Datacite mais a priori, le changement vers la landing page et la création des DOIs devrait démarrer sous peu.
=> Il y aura peut-être quelques bugs pour la landing page à remonter au début...

Notamment : vérifier que le .Summary est bien en lecture pour tous !

Lorsqu'un DOI est attribué, il est impossible de le supprimer. Si cela arrive, la landing page indiquera donc que le catalogue n'est plus disponible et pour quelle raison.

-- EmmanuellePerret - 2018-06-13

Topic attachments
I Attachment Action Size Date Who Comment
XMLxml fileName.xml manage 4.8 K 2018-06-13 - 12:34 EmmanuellePerret Exemple de fichier XML pour la création du DOI correspondant au catalogue J/A+A/610/A20 (first version)
XMLxml xmlExemple.xml manage 4.7 K 2018-06-13 - 12:32 EmmanuellePerret Exemple de fichier XML pour la création du DOI correspondant au catalogue J/A+A/610/A20 (updated)
Topic revision: r2 - 2018-06-15 - EmmanuellePerret
 
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